Суммы НДС, предъявленные поставщиками товаров (работ, услуг), имущественных прав или уплаченные при ввозе товаров на территорию РФ, учитываются налогоплательщиками в целях налогообложения одним из следующих способов:
1) принимаются к вычету (возмещению), если приобретения предназначены для осуществления облагаемых НДС операций ст. ст. 171, 172, 176 НК РФ
2) учитываются в стоимости приобретенных товаров (работ, услуг), имущественных прав, в том числе основных средств и нематериальных активов, если такие товары (работы, услуги), имущественные права:
- предназначены для операций по производству и (или) реализации (а также передаче, выполнению, оказанию для собственных нужд) товаров (работ, услуг), не облагаемых НДС (освобожденных от налогообложения);
- предназначены для операций по производству и (или) реализации товаров (работ, услуг), местом реализации которых не признается территория РФ;
- приобретены лицами, не являющимися налогоплательщиками НДС или освобожденными от исполнения обязанностей налогоплательщика по исчислению и уплате налога;
- предназначены для производства и (или) реализации (передачи) товаров (работ, услуг), операции по реализации (передаче) которых не признаются реализацией товаров (работ, услуг) в соответствии с п. 2 ст. 146 НК РФ.
Если в одном налоговом периоде налогоплательщик осуществляет операции, подлежащие налогообложению, и операции, не облагаемые НДС, то он обязан вести раздельный учет таких операций (п. 4 ст. 149 НК РФ) и раздельный учет сумм предъявленного поставщиками НДС (п. 4 ст. 170 НК РФ).
При ведении раздельного учета суммы входного НДС по приобретенным товарам (работам, услугам), имущественным правам (п. 4 ст. 170 НК РФ):
- учитываются в стоимости при использовании приобретений для осуществления операций, не облагаемых НДС операций;
- принимаются к вычету при использовании приобретений для осуществления операций, облагаемых НДС;
- принимаются к вычету либо учитываются в их стоимости в той пропорции, в которой они используются для производства и (или) реализации товаров (работ, услуг), имущественных прав, операции по реализации которых подлежат налогообложению (освобождены от налогообложения), - по товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, имущественным правам, используемым для осуществления как облагаемых налогом, так и не подлежащих налогообложению (освобожденных от налогообложения) операций, в порядке, установленном принятой налогоплательщиком учетной политикой для целей налогообложения, и с учетом особенностей, установленных п. 4.1 ст. 170 НК РФ.
В тех налоговых периодах, в которых доля совокупных расходов на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг), имущественных прав, реализация которых не облагается НДС, не превышает 5 процентов общей величины совокупных расходов на приобретение, производство и (или) реализацию товаров (работ, услуг), имущественных прав, налогоплательщик вправе не производиться распределение входного НДС. При этом суммы налога, подлежащие распределению по приобретенным товарам (работам, услугам), имущественным правам, в указанном налоговом периоде принимаются к вычету в полном объеме.
При приобретении товаров, работ, услуг, имущественных прав, используемых в операциях, местом реализации которых не признается территория РФ, также необходимо вести раздельных учет "входного" НДС. Причем это относится не только к расходам, непосредственно связанным с производством и реализацией товаров (работ, услуг), но и к общехозяйственным расходам (постановление Президиума ВАС РФ от 05.07.2011 № 1407/11 п. 2.2 Определения Конституционного Суда РФ от 04.06.2013 № 966-О).